Апробация нового маркера ядерной ДНК для исследований гибридизации крапчатого (Spermophilus suslicus Güld.) и большого сусликов.

Категория: биология
Скачивание доступно только для авторизованных пользователей
Авторы (ПГУ): Титов Сергей Витальевич [25]  , Кузьмин Антон Алексеевич [25]  , Закс Светлана Сергеевна [25]  , Чернышова Ольга Валерьевна [25]  
Аннотация: Актуальность и цели. Исследование гибридных популяций в пространстве и времени является актуальной задачей эволюционной биологии и популяционной экологии. Несмотря на довольно успешное изучение современных гибридных зон сусликов (Rodentia, Sciuridae, Spermophilus) в Поволжье, в процессе слежения за гибридными популяциями постоянно возникают вопросы по использованию для этого молекулярно-генетических маркеров. Целью исследования было изучение эффективности применения ранее не используемого маркера яДНК - фрагмента гена HOX b5 - в диагностике видовой принадлежности особей в контактных поселениях большого и крапчатого сусликов. Материалы и методы. Генетический материал для работы был собран в Ульяновской области в ходе проведения полевых работ по изучению гибридной зоны большого и крапчатого сусликов в 2018 г. Аналитическая выборка составила 28 особей S. suslicus, 41 особь S. major и 5 межвидовых гибридов, выявленных другими молекулярно-генетическими маркерами ранее. Полученные 69 фрагментов гена HOX b5 крапчатых и больших сусликов были секвенированы. Генетический анализ полученных последовательностей фрагмента гена HOX b5 был проведен при использовании пакета программ MEGA 7.0.21 и DnaSP 5.10. По полученным нуклеотидным последовательностям выявляли видоспецифические особенности этого маркера. Результаты. Анализ нуклеотидных последовательностей фрагмента гена HOX b5 (716 пн) больших сусликов ( n = 41) выявил пять гаплотипов, а у крапчатых сусликов ( n = 28) - только два гаплотипа - “Ss A” и “Ss G”. Проанализированный фрагмент ядерного маркера HOX b5 содержит как сайты, надежно дифференцирующие гаплотипы у каждого из гибридизирующих видов, так и сайт, имеющий специфическую для видов замену G-C (позиция 308), создающую участок узнавания рестрикционной эндонуклеазы BmeI 3901. Выводы. Результаты проведенных исследований изменчивости нуклеотидных последовательностей гена HOX b5 у двух видов гибридизирующих сусликов в Поволжье и выявление видоспецифических нуклеотидных особенностей этих последовательностей свидетельствуют о хорошей диагностической способности этого молекулярно-генетического маркера в исследовании генетического статуса особей из контактных поселений.
Тип: Статья
Вид: электронная копия бумажного издания
Количество частей: 1
Год издания: 2018
Издательство:
Где опубликовано: Журнал
Индексация: РИНЦ
Целевая аудитория: Исследователь, Преподаватель, Учащийся
Целевое назначение: Научно-популярное, Научное, Учебное
Отрасль науки: 03.02.08 Экология (по отраслям)
Лицензия: Нет ограничений
Ограничения: Нет ограничений
Правообладатель: ПГУ
ISSN: 2307-9150
УДК: 591.557:599.322.2
DOI: 10.21685/2307-9150-2018-4-8
Импакт-фактор журнала (SJR): 0,191
Страницы (с ... по ...): с 72 по 79
Том: 4(24)
Язык: Русский
Место хранения:Электронная библиотека ПГУ
Дата размещения:05.11.2019
Владелец:Чернышова Ольга Валерьевна
Ссылка на ресурс:
http://elib.pnzgu.ru/library/1572969204
Формат: Не указан