Главная
» Электронная библиотека » Новые данные к полиморфизму поволжской популяции орла-могильника (Aquila heliaca, Falconiformes, Accipitridae) по результатам анализа митохондриальной и микросателлитной ДНК
Новые данные к полиморфизму поволжской популяции орла-могильника (Aquila heliaca, Falconiformes, Accipitridae) по результатам анализа митохондриальной и микросателлитной ДНК
| Категория: | биология |
Скачивание доступно только для авторизованных пользователей
|
| Авторы (ПГУ): | Титов Сергей Витальевич [100]  | |
| Аннотация: | Актуальность и цели. Анализ имеющихся данных по изучению полиморфизму контрольного региона мтДНК в евразийских популяциях орлов-могильников (1996–2020 гг.) свидетельствуют об их генетической дифференциации по географическому распространению, а периодичное обнаружение новых гаплотипов указывает на актуальность таких исследований и недостаточную изученность данного вопроса. Целью работы было уточнение уровня полиморфизма и выявление специфических генетических черт поволжской популяции орла-могильника (А. heliaca) по данным анализа изменчивости митохондриальной и микросателлитной ДНК. Материалы и методы. Материалом для генетических исследований послужили новые сборы (n = 22) линных перьев орлов-могильников, коллекционированных в Ульяновской области (n = 15), Республиках Татарстан (n = 4) и Мордовия (n = 2) и Чувашской Республике (n = 1). ДНК выделяли из линных перьев взрослых птиц и пульпы и крови птенцов по стандартной методике фенол-хлороформной экстракции. Для генетического анализа использовали фрагмент (345 пн) контрольного региона мтДНК (D-loop) и три тетрануклеотидных микросателлитных повтора (IEAAAG09, IEAAAG11, IEAAAG15). Секвенирование фрагментов контрольного региона мтДНК (n = 22) и микросателлитной ДНК (n = 171) проводили на секвенаторе ABI 3500 (Applied Biosystems). Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразие изучали с помощью программы DnaSP 5.10.01. Для реконструкции филогенетических отношений использовали методы максимального правдоподобия (ML) и присоединения соседа (NJ) в программе MEGA X. Анализ микросателлитных генетических данных осуществляли при использовании программ Arlequin 3.5.2 и Structure 2.3.4. Полученные нуклеотидные последовательности вновь выявленных гаплотипов мтДНК орла-могильника были депонированы в GenBank NCBI под номерами OK504653 (гаплотип RE) и OK504654 (гаплотип RF). Для статистической обработки результатов для всех тестов был установлен уровень значимости p < 0.05. Результаты. Анализ распределение гаплотипов контрольного региона мтДНК по 5 географически изолированным гнездовым группам орла-могильника в Поволжье (UlR-NW – северо-запад Ульяновской области, UlR-NE – северо-восток Ульяновской области, UlR-С – центр Ульяновской области, UlR-S – юг Ульяновской области, RTat – Республика Татарстан) выявил их подразделенность. При анализе средних чисел нуклеотидных различий заметна обособленность гнездовых группы из Республики Татарстан и Ульяновской области. Среднее число нуклеотидных различий (k) между всеми гнездовыми группами составило 1.606 и оказалось ниже этого показателя при сравнении группы из Татарстана с ульяновскими группами (1.739). В филогенетическом анализе выделили две гаплогруппы орла-могильника. Первую гаплогруппу (AqH_1) формируют гаплотипы мтДНК, характеризующиеся одной или двумя нуклеотидными заменами. Вторая гаплогруппа (AqH_2), напротив, состоит из гаплотипов, имеющих от 3 до 5 нуклеотидных замен. Результаты медианного теста также указывают на существование 2 генетически близких групп последовательностей фрагмента контрольного региона мтДНК, соответствующих в бóльшей и мéньшей степени измененным гаплотипам. Проведенный анализ микросателлитной ДНК географически изолированных гнездовых групп орлов-могильников на территории Ульяновской области выявил низкий уровень внутреннего полиморфизма. Заключение. Проведенные исследования показали, что поволжская популяция является генетически дифференцированной. Она состоит из двух субпопуляций – ульяновской и татарстанской, характеризующихся специфическими гаплотипами мтДНК, и приуроченных к различным возвышенностям – к Приволжской и Бугульминско-Белебеевской. Не смотря на эти выявленные различия анализ микросателлитной ДНК, а также реконструкция эволюционных событий, связанных с изменчивости гаплотипов мтДНК показывают, что уровень полиморфизма ульяновской субпопуляции орлов-могильников является низким, а сама популяция достаточно однородной. | |
| Тип: | Статья | |
| Вид: | электронная копия бумажного издания | |
| Количество частей: | 1 | |
| Год издания: | 2021 | |
| Издательство: | Пензенский государственный университет (Пенза) | |
| Целевая аудитория: | Исследователь | |
| Целевое назначение: | Научное | |
| Лицензия: | Нет ограничений | |
| Ограничения: | Нет ограничений | |
| Правообладатель: | ПГУ | |
| ISSN: | 2500-0578 | |
| УДК: | УДК 598.279.23:575.2(470.4) | |
| DOI: | https://doi.org/10.21685/2500-0578-2021-3-2 | |
| Библиографическая ссылка: | Симаков М. Д., Корепов М. В., Стрюков С. А., Корепова Д. А., Кузьмин А. А., Титов С. В. Новые данные к полиморфизму поволжской популяции орла-могильника (Aquila heliaca, Falconiformes, Accipitridae) по результатам анализа митохондриальной и микросателлитной ДНК // Russian Journal of Ecosystem Ecology. 2021. Vol. 6 (3). https://doi.org/10.21685/2500-0578-2021-3-2 | |
| Внешняя веб-ссылка: | http://rjee.ru/rjee-6-3-2021-2/ | |
| Язык: | Русский | |
| Место хранения: | ИР открытого доступа | |
| Дата размещения: | 26.11.2021 | |
| Владелец: | Титов Сергей Витальевич | |
| Ссылка на ресурс: | http://elib.pnzgu.ru/library/1636829836  | |
| Формат: | Не указан |